MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4b

Total Repeats: 2183

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_011991	CTG	2	6	119889	119894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109215
2002	NC_011991	CTG	3	9	119906	119914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109215
2003	NC_011991	CCGA	2	8	119915	119922	25 %	0 %	25 %	50 %	222109215
2004	NC_011991	CGAT	2	8	119943	119950	25 %	25 %	25 %	25 %	222109215
2005	NC_011991	ACC	2	6	119961	119966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109215
2006	NC_011991	TGT	3	9	119971	119979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109215
2007	NC_011991	TCC	2	6	120008	120013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109215
2008	NC_011991	GGTT	2	8	120101	120108	0 %	50 %	50 %	0 %	222109215
2009	NC_011991	GCGG	2	8	120113	120120	0 %	0 %	75 %	25 %	222109215
2010	NC_011991	ATG	2	6	120177	120182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109215
2011	NC_011991	TCT	2	6	120193	120198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109215
2012	NC_011991	CCG	2	6	120205	120210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109215
2013	NC_011991	GCT	2	6	120214	120219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109215
2014	NC_011991	CG	3	6	120250	120255	0 %	0 %	50 %	50 %	222109215
2015	NC_011991	TGATA	2	10	120286	120295	40 %	40 %	20 %	0 %	222109215
2016	NC_011991	CGT	2	6	120308	120313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109215
2017	NC_011991	GCG	2	6	120379	120384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109215
2018	NC_011991	GAC	2	6	120390	120395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109215
2019	NC_011991	CGA	2	6	120427	120432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109215
2020	NC_011991	GCTGCA	2	12	120457	120468	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222109215
2021	NC_011991	GAC	2	6	120494	120499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109215
2022	NC_011991	AGAT	2	8	120522	120529	50 %	25 %	25 %	0 %	222109215
2023	NC_011991	CTTG	2	8	120599	120606	0 %	50 %	25 %	25 %	222109215
2024	NC_011991	GCA	2	6	120618	120623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109215
2025	NC_011991	CGCA	2	8	120674	120681	25 %	0 %	25 %	50 %	222109215
2026	NC_011991	GCG	2	6	120796	120801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109216
2027	NC_011991	GCCC	2	8	120851	120858	0 %	0 %	25 %	75 %	222109216
2028	NC_011991	CAGTC	2	10	120874	120883	20 %	20 %	20 %	40 %	222109216
2029	NC_011991	TGT	2	6	120916	120921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109216
2030	NC_011991	GTT	2	6	120983	120988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109216
2031	NC_011991	GATC	2	8	121073	121080	25 %	25 %	25 %	25 %	222109216
2032	NC_011991	ACG	2	6	121116	121121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109216
2033	NC_011991	TCG	2	6	121125	121130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109216
2034	NC_011991	CCCG	2	8	121154	121161	0 %	0 %	25 %	75 %	222109216
2035	NC_011991	CTGG	2	8	121214	121221	0 %	25 %	50 %	25 %	222109216
2036	NC_011991	GCC	2	6	121310	121315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109216
2037	NC_011991	CATTC	2	10	121324	121333	20 %	40 %	0 %	40 %	222109216
2038	NC_011991	CGC	2	6	121340	121345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109216
2039	NC_011991	GCC	2	6	121420	121425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109217
2040	NC_011991	GCC	2	6	121470	121475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109217
2041	NC_011991	GGC	2	6	121500	121505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109217
2042	NC_011991	TGC	2	6	121509	121514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109217
2043	NC_011991	AGCCG	2	10	121527	121536	20 %	0 %	40 %	40 %	222109217
2044	NC_011991	CGG	2	6	121580	121585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109217
2045	NC_011991	GCT	2	6	121686	121691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109217
2046	NC_011991	ACG	2	6	121708	121713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109217
2047	NC_011991	GAT	2	6	121719	121724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109217
2048	NC_011991	GAC	2	6	121755	121760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109217
2049	NC_011991	TTC	2	6	121794	121799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109217
2050	NC_011991	GC	3	6	121848	121853	0 %	0 %	50 %	50 %	222109217
2051	NC_011991	ATC	2	6	121855	121860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109217
2052	NC_011991	CCG	2	6	121939	121944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109217
2053	NC_011991	ACAT	2	8	121978	121985	50 %	25 %	0 %	25 %	222109217
2054	NC_011991	CCA	2	6	121988	121993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109217
2055	NC_011991	CGAAA	2	10	121998	122007	60 %	0 %	20 %	20 %	222109217
2056	NC_011991	CGAG	2	8	122018	122025	25 %	0 %	50 %	25 %	222109217
2057	NC_011991	CAC	2	6	122034	122039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109217
2058	NC_011991	GAT	3	9	122052	122060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109217
2059	NC_011991	CCG	2	6	122167	122172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109217
2060	NC_011991	CGA	2	6	122198	122203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109217
2061	NC_011991	CTG	2	6	122226	122231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109217
2062	NC_011991	ATA	2	6	122260	122265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222109217
2063	NC_011991	CGG	2	6	122324	122329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109217
2064	NC_011991	GATC	2	8	122442	122449	25 %	25 %	25 %	25 %	222109217
2065	NC_011991	CGA	2	6	122486	122491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109217
2066	NC_011991	TGC	2	6	122520	122525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109217
2067	NC_011991	ACC	2	6	122806	122811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109218
2068	NC_011991	GCC	2	6	122828	122833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109218
2069	NC_011991	CGG	2	6	122843	122848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109218
2070	NC_011991	GAA	2	6	122858	122863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109218
2071	NC_011991	CAT	2	6	122924	122929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109218
2072	NC_011991	CTG	2	6	122978	122983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109218
2073	NC_011991	GACG	2	8	123026	123033	25 %	0 %	50 %	25 %	222109218
2074	NC_011991	CTG	2	6	123083	123088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109218
2075	NC_011991	GCC	2	6	123116	123121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109218
2076	NC_011991	GA	3	6	123163	123168	50 %	0 %	50 %	0 %	222109218
2077	NC_011991	CGT	2	6	123232	123237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109218
2078	NC_011991	CTG	2	6	123272	123277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109218
2079	NC_011991	GCA	2	6	123352	123357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109218
2080	NC_011991	TGG	2	6	123399	123404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109218
2081	NC_011991	CTG	2	6	123410	123415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109218
2082	NC_011991	TTG	2	6	123471	123476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109218
2083	NC_011991	GAC	2	6	123524	123529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109218
2084	NC_011991	GCA	2	6	123586	123591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109218
2085	NC_011991	TTGA	2	8	123605	123612	25 %	50 %	25 %	0 %	222109219
2086	NC_011991	GTG	2	6	123639	123644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109219
2087	NC_011991	CGA	2	6	123692	123697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109219
2088	NC_011991	GGC	3	9	123734	123742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109219
2089	NC_011991	GTGGCG	2	12	123778	123789	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	222109219
2090	NC_011991	ATG	2	6	123910	123915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109219
2091	NC_011991	CGA	2	6	123973	123978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109219
2092	NC_011991	GC	3	6	124064	124069	0 %	0 %	50 %	50 %	222109219
2093	NC_011991	CCT	2	6	124247	124252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109219
2094	NC_011991	CTT	2	6	124260	124265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109219
2095	NC_011991	GCG	2	6	124296	124301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109219
2096	NC_011991	ATTGC	2	10	124336	124345	20 %	40 %	20 %	20 %	222109219
2097	NC_011991	ATG	3	9	124375	124383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109219
2098	NC_011991	CCG	2	6	124400	124405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109219
2099	NC_011991	CAT	2	6	124475	124480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109219
2100	NC_011991	GCTG	2	8	124544	124551	0 %	25 %	50 %	25 %	222109219
2101	NC_011991	TGC	2	6	124572	124577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109219
2102	NC_011991	TG	3	6	124629	124634	0 %	50 %	50 %	0 %	222109219
2103	NC_011991	CCA	2	6	124685	124690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109219
2104	NC_011991	GCG	2	6	124697	124702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109219
2105	NC_011991	GGC	2	6	124904	124909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109219
2106	NC_011991	GGC	2	6	124925	124930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109219
2107	NC_011991	CAT	2	6	124940	124945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109219
2108	NC_011991	GT	3	6	124970	124975	0 %	50 %	50 %	0 %	222109219
2109	NC_011991	GCA	2	6	125008	125013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109219
2110	NC_011991	AAC	2	6	125080	125085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109219
2111	NC_011991	CTT	2	6	125118	125123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109219
2112	NC_011991	CATGAA	2	12	125163	125174	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	222109219
2113	NC_011991	ACC	2	6	125183	125188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109219
2114	NC_011991	CGG	2	6	125315	125320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109219
2115	NC_011991	TCG	2	6	125410	125415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109219
2116	NC_011991	GCC	2	6	125433	125438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109219
2117	NC_011991	ACG	2	6	125479	125484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109219
2118	NC_011991	GT	3	6	125606	125611	0 %	50 %	50 %	0 %	222109219
2119	NC_011991	TCC	2	6	126017	126022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109220
2120	NC_011991	CAT	2	6	126105	126110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109220
2121	NC_011991	CGA	3	9	126122	126130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109220
2122	NC_011991	GAT	2	6	126138	126143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109220
2123	NC_011991	CGG	2	6	126155	126160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109220
2124	NC_011991	TCA	2	6	126209	126214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109220
2125	NC_011991	CAG	2	6	126240	126245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109220
2126	NC_011991	GGCC	2	8	126246	126253	0 %	0 %	50 %	50 %	222109220
2127	NC_011991	GA	3	6	126256	126261	50 %	0 %	50 %	0 %	222109220
2128	NC_011991	CCG	2	6	126371	126376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109221
2129	NC_011991	AAG	2	6	126403	126408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109221
2130	NC_011991	ACG	2	6	126425	126430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109221
2131	NC_011991	GAC	2	6	126438	126443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109221
2132	NC_011991	CCA	2	6	126464	126469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109221
2133	NC_011991	CTG	2	6	126541	126546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109221
2134	NC_011991	TCCC	2	8	126562	126569	0 %	25 %	0 %	75 %	222109221
2135	NC_011991	ACC	2	6	126577	126582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109221
2136	NC_011991	GCA	2	6	126593	126598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109221
2137	NC_011991	CAT	3	9	126613	126621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109221
2138	NC_011991	CGA	2	6	126848	126853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109222
2139	NC_011991	GGC	2	6	126873	126878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109222
2140	NC_011991	GAG	2	6	126939	126944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109222
2141	NC_011991	TGC	2	6	126951	126956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109222
2142	NC_011991	GAT	2	6	126978	126983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109222
2143	NC_011991	GTG	2	6	127042	127047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109222
2144	NC_011991	TTC	2	6	127063	127068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109222
2145	NC_011991	GAA	2	6	127142	127147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109222
2146	NC_011991	CCA	2	6	127183	127188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109222
2147	NC_011991	GTG	2	6	127246	127251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109222
2148	NC_011991	TCC	2	6	127261	127266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109222
2149	NC_011991	CGGCGC	2	12	127320	127331	0 %	0 %	50 %	50 %	222109222
2150	NC_011991	GGT	2	6	127336	127341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109222
2151	NC_011991	TCC	2	6	127362	127367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109222
2152	NC_011991	GAT	2	6	127386	127391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109222
2153	NC_011991	TCGC	2	8	127395	127402	0 %	25 %	25 %	50 %	222109222
2154	NC_011991	ACAA	2	8	127507	127514	75 %	0 %	0 %	25 %	222109222
2155	NC_011991	CAA	2	6	127568	127573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109222
2156	NC_011991	GGTG	2	8	128535	128542	0 %	25 %	75 %	0 %	222109223
2157	NC_011991	ACG	2	6	128543	128548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109223
2158	NC_011991	GTC	2	6	128560	128565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109223
2159	NC_011991	GCC	2	6	128577	128582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109223
2160	NC_011991	GAT	2	6	128623	128628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109223
2161	NC_011991	GGT	2	6	128639	128644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109223
2162	NC_011991	AAGAG	2	10	128682	128691	60 %	0 %	40 %	0 %	222109223
2163	NC_011991	GC	3	6	128704	128709	0 %	0 %	50 %	50 %	222109223
2164	NC_011991	CAG	2	6	128722	128727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109223
2165	NC_011991	GAC	2	6	128815	128820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109223
2166	NC_011991	TCT	2	6	128859	128864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109223
2167	NC_011991	CTC	2	6	128865	128870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109223
2168	NC_011991	AAC	2	6	128890	128895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109223
2169	NC_011991	ATC	2	6	128921	128926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109223
2170	NC_011991	GAAA	2	8	128943	128950	75 %	0 %	25 %	0 %	222109223
2171	NC_011991	TCGGC	2	10	129096	129105	0 %	20 %	40 %	40 %	222109223
2172	NC_011991	CTT	2	6	129222	129227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109224
2173	NC_011991	AACTG	2	10	129247	129256	40 %	20 %	20 %	20 %	222109224
2174	NC_011991	GAA	2	6	129293	129298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109224
2175	NC_011991	ATGGA	2	10	129324	129333	40 %	20 %	40 %	0 %	222109224
2176	NC_011991	ATT	2	6	129392	129397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222109224
2177	NC_011991	TTC	2	6	129477	129482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109224
2178	NC_011991	TCA	2	6	129516	129521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109224
2179	NC_011991	CCG	2	6	129573	129578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109224
2180	NC_011991	TG	3	6	129711	129716	0 %	50 %	50 %	0 %	222109224
2181	NC_011991	CAG	2	6	129781	129786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109224
2182	NC_011991	CGTT	2	8	129816	129823	0 %	50 %	25 %	25 %	222109224
2183	NC_011991	CGG	2	6	129861	129866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109224

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